- Afet Yönetimi Uygulama ve Araştırma Merkezi (AFET)
   - Bilgisayar Destekli Tasarım, İmalat ve Robotik Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİLTİR)
   - Bilim ve Teknoloji Politikaları Araştırma Merkezi (TEKPOL)
   - E-Devlet Araştırma ve Uygulama Merkezi (EDMER)
   - Girişimcilik Araştırma ve Uygulama Merkezi (GIMER)
   - Görsel-İşitsel Sistemler Araştırma ve Üretim Merkezi (GİSAM)
   - İnsan Hakları ve Güvenliği Uluslararası Araştırma ve Uygulama Merkezi
   - İnşaat Sektörü Eğitim Araştırma Merkezi (ISEM)
   - Karadeniz ve Orta Asya Ülkeleri Araştırma Merkezi (KORA)
   - Kaynak Teknolojisi ve Tahribatsiz Muayene Araştırma Merkezi (KAYNAK)
   - Konfüçyus Uygulama ve Araştırma Merkezi
   - Merkezi Laboratuvar
      - AR-GE Eğitim ve Ölçme Merkezi
      - Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji AR-GE Merkezi
   - ODTÜ GAP Araştırma Merkezi (GAP)
   - Mikro-Elektro-Mekanik Sistemler Araştırma ve Uygulama Merkezi (ODTÜ-MEMS)
   - ODTÜ - PIGM Petrol Araştırma Merkezi (PAL)
   - ODTÜ - TSK Modelleme ve Simülasyon Merkezi (MODSIM)
   - Sürekli Eğitim Merkezi (SEM)
   - Tarihsel Çevre Değerlerini Araş. ve Uygulama Merkezi (TAÇDAM)
   - Toplum Bilim Uygulama ve Araştırma Merkezi (TBM)
   - Uygulamalı Etik Araştırma Merkezi (UEAM)

   - Avrupa Çalışmalari Merkezi
   - Bitki Biyoteknolojileri Araştırma Laboratuarı
   - Bölge Araştırmaları Merkezi
   - Deniz Mühendisliği Araştırma Merkezi
   - Deprem Mühendisliği Araştırma Merkezi
   - Ekonomik Araştırmalar Merkezi
   - İşletmecilik ve Yönetim Sistemleri Araştırma Merkezi (İYSE)
   - Jeoloji ve Jeofizik Araştırma Merkezi
   - Kamu Politikaları ve Kentsel Araştırmalar Merkezi (KAPKA)
   - Konut Araştırmaları Merkezi
   - Makine Tasarım ve İmalat Araştırma Merkezi (MATIMAREN)
   - Mimarlık Fakültesi Tasarım Araştırma Planlama ve Uygulama Merkezi (MATPUM)
   - Özel ve Yüksek Yapılar Mühendisliği Araştırma Merkezi
   - Su Kaynakları Mühendisliği Araştırma Merkezi
   - Ulaştırma Mühendisliği Araştırma Merkezi
   - Psikoloji Bölümü, Uygulama, Araştırma ve Eğitim Merkezi (UYAREM)
   - Uzaktan Ögrenme Uygulama ve Araştırma Merkezi
   - Yazılım Araştırma ve Geliştirme Merkezi (SRDC)
   - Zemin Mekaniği ve Temel Mühendisliği Araştırma Merkezi

   - Türk Hava Kuvvetleri - ODTÜ Ar-Ge ve İleri Eğitim Koordinasyon Merkezi
   - ODTÜ - KOSGEB Teknoloji Geliştirme Merkezi (TEKMER)
   - Uluslararası Isı ve Kütle Transferi Merkezi (ICHMT)
   - TÜBİTAK Birimleri
      - Uzay Teknolojileri Araştırma Enstitüsü (UZAY)
      - SAGE Savunma Sanayi Kontrol Labaratuvarı
      - Yüksek Enerji Astrofizik Araştırma Birimi

  -  Yaygınlaştırılmış Ulusal ve Ulusararası Projeler (YUUP)
  -  ODTÜ İlgi Alanları